Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SCHIP1Q9P0W5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SCHIP1Q9P0W5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms