Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EHD3Q9NZN3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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