Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSD3Q9NYI0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms