Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3EQ9NVU0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3EQ9NVU0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms