Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IMP3Q9NV31 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IMP3Q9NV31 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms