Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC4BQ9NT99 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms