Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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LHX9Q9NQ69 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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LHX9Q9NQ69 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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LHX9Q9NQ69 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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LHX9Q9NQ69 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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LHX9Q9NQ69 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX9Q9NQ69 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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