Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPCPD1Q9NPB8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms