Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRMS1Q9HCU9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms