Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDCL3Q9H2J4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms