Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CIPCQ9C0C6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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