Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF826P-204ENST00000597334 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 PSMC1P11-201ENST00000405257 1317 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRNT1-203ENST00000339437 976 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUSP19-201ENST00000342619 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 PCBP1-AS1-242ENST00000458686 1020 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC099524.1-207ENST00000569731 794 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC007346.1-202ENST00000602826 684 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL109653.2-201ENST00000625029 1065 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 NRXN1-203ENST00000378262 1338 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 TBC1D3P4-201ENST00000338790 1075 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP4-8Q9BYQ9 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms