Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TDRD1Q9BXT4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms