Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTDSS2Q9BVG9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms