Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC5LQ99459 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC5LQ99459 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms