Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX18Q96RF0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX18Q96RF0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms