Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SAMD8Q96LT4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SAMD8Q96LT4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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