Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COG3Q96JB2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG3Q96JB2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms