Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms