Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC102AQ96A19 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102AQ96A19 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms