Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS3Q969F9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS3Q969F9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms