Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRF1Q92994 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF1Q92994 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms