Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC4Q8WW27 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms