Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM8

AGBL3, Cytosolic carboxypeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL3Q8NEM8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGBL3Q8NEM8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGBL3Q8NEM8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms