Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HJURPQ8NCD3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HJURPQ8NCD3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms