Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VWDEQ8N2E2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWDEQ8N2E2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms