Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BBS12Q6ZW61 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms