Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRCAPQ6ZRS2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRCAPQ6ZRS2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms