Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCIMPQ6UWF3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCIMPQ6UWF3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms