Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHC4Q6S5L8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms