Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGMBQ6NW40 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGMBQ6NW40 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms