Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7Z2

YNL042W-B, Uncharacterized protein YNL042W-B, yeast

Predictions only

Length 85 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR309C	YOR309C	381 nt		-2.49	□□□□□ -2.81
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBR182C-A	YBR182C-A	195 nt		-2.51	□□□□□ -2.81
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-2.53	□□□□□ -2.81
YNL042W-B	Q3E7Z2	YEL014C	YEL014C	306 nt		-2.55	□□□□□ -2.82
YNL042W-B	Q3E7Z2	YJR157W	YJR157W	363 nt		-2.57	□□□□□ -2.82
YNL042W-B	Q3E7Z2	YMR172C-A	YMR172C-A	384 nt		-2.58	□□□□□ -2.82
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-2.58	□□□□□ -2.82
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR543C	YDR543C	300 nt		-2.59	□□□□□ -2.82
YNL042W-B	Q3E7Z2	YAL068W-A	YAL068W-A	255 nt		-2.59	□□□□□ -2.82
YNL042W-B	Q3E7Z2	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
YNL042W-B	Q3E7Z2	YKL063C	YKL063C	504 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-2.61	□□□□□ -2.83
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		-2.66	□□□□□ -2.84
YNL042W-B	Q3E7Z2	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-2.67	□□□□□ -2.84
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR78	snR78	87 nt		-2.68	□□□□□ -2.84
YNL042W-B	Q3E7Z2	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-2.7	□□□□□ -2.84
YNL042W-B	Q3E7Z2	YNR025C	YNR025C	360 nt		-2.76	□□□□□ -2.85
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-2.76	□□□□□ -2.85
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGR035C	YGR035C	351 nt		-2.77	□□□□□ -2.85
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-2.78	□□□□□ -2.85
YNL042W-B	Q3E7Z2	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		-2.79	□□□□□ -2.86
YNL042W-B	Q3E7Z2	YAL063C-A	YAL063C-A	291 nt		-2.8	□□□□□ -2.86
YNL042W-B	Q3E7Z2	ATP19	YOL077W-A	207 nt		-2.8	□□□□□ -2.86
YNL042W-B	Q3E7Z2	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-2.81	□□□□□ -2.86
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-2.81	□□□□□ -2.86
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-2.82	□□□□□ -2.86
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		-2.86	□□□□□ -2.87
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-2.88	□□□□□ -2.87
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR102W	YOR102W	351 nt		-2.88	□□□□□ -2.87
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPR012W	YPR012W	255 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPR197C	YPR197C	564 nt		-2.89	□□□□□ -2.87
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR55	snR55	98 nt		-2.9	□□□□□ -2.87
YNL042W-B	Q3E7Z2	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-2.9	□□□□□ -2.87
YNL042W-B	Q3E7Z2	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-2.91	□□□□□ -2.88
YNL042W-B	Q3E7Z2	YER181C	YER181C	324 nt		-2.92	□□□□□ -2.88
YNL042W-B	Q3E7Z2	Q0142	Q0142	177 nt		-2.93	□□□□□ -2.88
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-2.97	□□□□□ -2.88
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-2.98	□□□□□ -2.89
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR48	snR48	113 nt		-2.98	□□□□□ -2.89
YNL042W-B	Q3E7Z2	YKL118W	YKL118W	312 nt		-3.04	□□□□□ -2.9
YNL042W-B	Q3E7Z2	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-3.05	□□□□□ -2.9
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR413C	YDR413C	576 nt		-3.06	□□□□□ -2.9
YNL042W-B	Q3E7Z2	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-3.07	□□□□□ -2.9
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR6	snR6	112 nt		-3.1	□□□□□ -2.91
YNL042W-B	Q3E7Z2	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		-3.12	□□□□□ -2.91
YNL042W-B	Q3E7Z2	YJL150W	YJL150W	303 nt		-3.15	□□□□□ -2.91
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-3.18	□□□□□ -2.92
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-3.24	□□□□□ -2.93
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR73	snR73	106 nt		-3.25	□□□□□ -2.93
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR80	snR80	171 nt		-3.25	□□□□□ -2.93
YNL042W-B	Q3E7Z2	RPL39	YJL189W	156 nt		-3.25	□□□□□ -2.93
YNL042W-B	Q3E7Z2	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-3.25	□□□□□ -2.93
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-3.26	□□□□□ -2.93
YNL042W-B	Q3E7Z2	GIM4	YEL003W	336 nt		-3.28	□□□□□ -2.93
YNL042W-B	Q3E7Z2	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-3.31	□□□□□ -2.94
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-3.31	□□□□□ -2.94
YNL042W-B	Q3E7Z2	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-3.33	□□□□□ -2.94
YNL042W-B	Q3E7Z2	RPL41A	YDL184C	78 nt		-3.34	□□□□□ -2.94
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR52	snR52	92 nt		-3.37	□□□□□ -2.95
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR56	snR56	88 nt		-3.38	□□□□□ -2.95
YNL042W-B	Q3E7Z2	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		-3.38	□□□□□ -2.95
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR302W	YOR302W	78 nt		-3.39	□□□□□ -2.95
YNL042W-B	Q3E7Z2	YNL198C	YNL198C	303 nt		-3.42	□□□□□ -2.96
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR38	snR38	95 nt		-3.46	□□□□□ -2.96
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR524C-A	YDR524C-A	120 nt		-3.47	□□□□□ -2.96
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		-3.53	□□□□□ -2.97
YNL042W-B	Q3E7Z2	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-3.56	□□□□□ -2.98
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR157W	YDR157W	402 nt		-3.62	□□□□□ -2.99
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-3.66	□□□□□ -3
YNL042W-B	Q3E7Z2	YJR162C	YJR162C	351 nt		-3.66	□□□□□ -3
YNL042W-B	Q3E7Z2	YNL337W	YNL337W	255 nt		-3.66	□□□□□ -3
YNL042W-B	Q3E7Z2	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-3.74	□□□□□ -3.01
YNL042W-B	Q3E7Z2	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-3.74	□□□□□ -3.01
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-3.76	□□□□□ -3.01
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-3.79	□□□□□ -3.02
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR85	snR85	171 nt		-3.82	□□□□□ -3.02
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGR151C	YGR151C	336 nt		-3.83	□□□□□ -3.02
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-3.85	□□□□□ -3.03
YNL042W-B	Q3E7Z2	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-3.85	□□□□□ -3.03
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR47	snR47	99 nt		-3.86	□□□□□ -3.03
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		-3.89	□□□□□ -3.03
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBL053W	YBL053W	375 nt		-3.89	□□□□□ -3.03
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR65	snR65	100 nt		-3.92	□□□□□ -3.04
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR87	snR87	109 nt		-3.98	□□□□□ -3.05
YNL042W-B	Q3E7Z2	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-4.02	□□□□□ -3.05
YNL042W-B	Q3E7Z2	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-4.05	□□□□□ -3.06
YNL042W-B	Q3E7Z2	YKL225W	YKL225W	348 nt		-4.09	□□□□□ -3.06
YNL042W-B	Q3E7Z2	SPG3	YDR504C	384 nt		-4.12	□□□□□ -3.07
YNL042W-B	Q3E7Z2	Q0017	Q0017	162 nt		-4.15	□□□□□ -3.07
YNL042W-B	Q3E7Z2	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-4.22	□□□□□ -3.08
YNL042W-B	Q3E7Z2	VAR1	Q0140	1197 nt		-4.3	□□□□□ -3.1
YNL042W-B	Q3E7Z2	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-4.31	□□□□□ -3.1
YNL042W-B	Q3E7Z2	YKL096C-B	YKL096C-B	150 nt		-4.32	□□□□□ -3.1
YNL042W-B	Q3E7Z2	snR58	snR58	96 nt		-4.41	□□□□□ -3.12
YNL042W-B	Q3E7Z2	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-4.41	□□□□□ -3.12
YNL042W-B	Q3E7Z2	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-4.42	□□□□□ -3.12
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-4.45	□□□□□ -3.12
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-4.51	□□□□□ -3.13
YNL042W-B	Q3E7Z2	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-4.55	□□□□□ -3.14
YNL042W-B	Q3E7Z2	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-4.72	□□□□□ -3.17

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 86.5 ms