Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC27Q2M243 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC27Q2M243 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms