Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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