Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIK5Q16478 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK5Q16478 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
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