Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKIV2LQ15477 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms