Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SF3A1Q15459 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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