Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDGFRLQ15198 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDGFRLQ15198 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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