Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SEMA3AQ14563 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SEMA3AQ14563 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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