Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PDE6HQ13956 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PDE6HQ13956 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDE6HQ13956 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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