Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX3Q13761 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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