Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CUL1Q13616 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CUL1Q13616 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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