Protein–RNA interactions for Protein: Q12161

PSH1, RING finger protein PSH1, yeastyeast

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSH1Q12161 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.62□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.62□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.62□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.62□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.62□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.62□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.62□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.61□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.6□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.6□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 LAA1YJL207C 6045 nt1.6□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.59□□□□□ -2.15
PSH1Q12161 EST2YLR318W 2655 nt1.59□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 CLU1YMR012W 3834 nt1.58□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.58□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.57□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 SIP4YJL089W 2490 nt1.55□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 NST1YNL091W 3723 nt1.55□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.55□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 YJR029WYJR029W 5268 nt1.54□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.54□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 IML1YJR138W 4755 nt1.54□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.53□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 SKI7YOR076C 2244 nt1.53□□□□□ -2.16
PSH1Q12161 BUL2YML111W 2763 nt1.53□□□□□ -2.17
PSH1Q12161 NIP1YMR309C 2439 nt1.52□□□□□ -2.17
PSH1Q12161 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt1.52□□□□□ -2.17
PSH1Q12161 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.51□□□□□ -2.17
PSH1Q12161 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.51□□□□□ -2.17
PSH1Q12161 PAU12YGR294W 363 nt1.51□□□□□ -2.17
PSH1Q12161 snR38snR38 95 nt1.51□□□□□ -2.17
PSH1Q12161 snR75snR75 89 nt1.49□□□□□ -2.17
PSH1Q12161 AI1Q0050 2505 nt1.49□□□□□ -2.17
PSH1Q12161 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.48□□□□□ -2.17
PSH1Q12161 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.44□□□□□ -2.18
PSH1Q12161 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.44□□□□□ -2.18
PSH1Q12161 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.42□□□□□ -2.18
PSH1Q12161 SPT7YBR081C 3999 nt1.39□□□□□ -2.19
PSH1Q12161 RKR1YMR247C 4689 nt1.37□□□□□ -2.19
PSH1Q12161 BEM2YER155C 6504 nt1.35□□□□□ -2.19
PSH1Q12161 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.34□□□□□ -2.19
PSH1Q12161 MLP2YIL149C 5040 nt1.31□□□□□ -2.2
PSH1Q12161 SCC2YDR180W 4482 nt1.29□□□□□ -2.2
PSH1Q12161 THO2YNL139C 4794 nt1.28□□□□□ -2.2
PSH1Q12161 DOP1YDR141C 5097 nt1.22□□□□□ -2.21
PSH1Q12161 VAM6YDL077C 3150 nt1.21□□□□□ -2.22
PSH1Q12161 snR67snR67 82 nt1.19□□□□□ -2.22
PSH1Q12161 PET111YMR257C 2403 nt1.16□□□□□ -2.22
PSH1Q12161 YPR117WYPR117W 7470 nt1.13□□□□□ -2.23
PSH1Q12161 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSH1Q12161 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSH1Q12161 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSH1Q12161 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSH1Q12161 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.13□□□□□ -2.23
PSH1Q12161 LTE1YAL024C 4308 nt1.1□□□□□ -2.23
PSH1Q12161 PAU24YBR301W 363 nt1.07□□□□□ -2.24
PSH1Q12161 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 YMR160WYMR160W 2451 nt0.98□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.98□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.98□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.98□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.98□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.98□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.98□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.97□□□□□ -2.25
PSH1Q12161 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.96□□□□□ -2.26
PSH1Q12161 MLP1YKR095W 5628 nt0.95□□□□□ -2.26
PSH1Q12161 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.91□□□□□ -2.26
PSH1Q12161 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.91□□□□□ -2.26
PSH1Q12161 UTP20YBL004W 7482 nt0.89□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.87□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 IQG1YPL242C 4488 nt0.85□□□□□ -2.27
PSH1Q12161 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.83□□□□□ -2.28
PSH1Q12161 FMP27YLR454W 7887 nt0.82□□□□□ -2.28
PSH1Q12161 SOV1YMR066W 2697 nt0.79□□□□□ -2.28
PSH1Q12161 YOL014WYOL014W 375 nt0.79□□□□□ -2.28
PSH1Q12161 snR40snR40 97 nt0.79□□□□□ -2.28
PSH1Q12161 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.78□□□□□ -2.28
PSH1Q12161 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.78□□□□□ -2.28
PSH1Q12161 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.75□□□□□ -2.29
PSH1Q12161 ESP1YGR098C 4893 nt0.75□□□□□ -2.29
PSH1Q12161 UTP10YJL109C 5310 nt0.7□□□□□ -2.3
PSH1Q12161 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.66□□□□□ -2.3
PSH1Q12161 snR77snR77 88 nt0.61□□□□□ -2.31
PSH1Q12161 SBH2YER019C-A 267 nt0.59□□□□□ -2.31
PSH1Q12161 PAU9YBL108C-A 129 nt0.52□□□□□ -2.33
PSH1Q12161 snR128snR128 126 nt0.5□□□□□ -2.33
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