Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOBRQ0VD83 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBRQ0VD83 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms