Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 PRP16YKR086W 3216 nt1.05□□□□□ -2.24
NEW1Q08972 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.04□□□□□ -2.24
NEW1Q08972 GLG1YKR058W 1851 nt1.03□□□□□ -2.24
NEW1Q08972 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt1.03□□□□□ -2.24
NEW1Q08972 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.03□□□□□ -2.24
NEW1Q08972 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.02□□□□□ -2.25
NEW1Q08972 snR47snR47 99 nt1.01□□□□□ -2.25
NEW1Q08972 RKR1YMR247C 4689 nt1□□□□□ -2.25
NEW1Q08972 SEC8YPR055W 3198 nt1□□□□□ -2.25
NEW1Q08972 PAU24YBR301W 363 nt0.98□□□□□ -2.25
NEW1Q08972 EST1YLR233C 2100 nt0.97□□□□□ -2.25
NEW1Q08972 ULP2YIL031W 3105 nt0.97□□□□□ -2.25
NEW1Q08972 BEM3YPL115C 3387 nt0.97□□□□□ -2.25
NEW1Q08972 RPM2YML091C 3609 nt0.96□□□□□ -2.26
NEW1Q08972 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.96□□□□□ -2.26
NEW1Q08972 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.96□□□□□ -2.26
NEW1Q08972 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.94□□□□□ -2.26
NEW1Q08972 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt0.94□□□□□ -2.26
NEW1Q08972 snR69snR69 101 nt0.93□□□□□ -2.26
NEW1Q08972 PAU12YGR294W 363 nt0.93□□□□□ -2.26
NEW1Q08972 CSE1YGL238W 2883 nt0.92□□□□□ -2.26
NEW1Q08972 YSP1YHR155W 3687 nt0.91□□□□□ -2.26
NEW1Q08972 LTE1YAL024C 4308 nt0.9□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.89□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 snR53snR53 91 nt0.89□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 snR64snR64 101 nt0.88□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.87□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.86□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 NIP1YMR309C 2439 nt0.86□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.85□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.85□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.85□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 snR38snR38 95 nt0.85□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.84□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.84□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.84□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.84□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
NEW1Q08972 BUL2YML111W 2763 nt0.84□□□□□ -2.28
NEW1Q08972 YKL225WYKL225W 348 nt0.83□□□□□ -2.28
NEW1Q08972 RDS3YPR094W 324 nt0.83□□□□□ -2.28
NEW1Q08972 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.79□□□□□ -2.28
NEW1Q08972 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.78□□□□□ -2.28
NEW1Q08972 AI1Q0050 2505 nt0.78□□□□□ -2.28
NEW1Q08972 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.77□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.75□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.75□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 snR50snR50 90 nt0.74□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.73□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 RPL41AYDL184C 78 nt0.72□□□□□ -2.29
NEW1Q08972 YMR160WYMR160W 2451 nt0.71□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.71□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 YOL014WYOL014W 375 nt0.7□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.7□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 UTP20YBL004W 7482 nt0.69□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 MLP1YKR095W 5628 nt0.69□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 PET111YMR257C 2403 nt0.68□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 MLP2YIL149C 5040 nt0.68□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.67□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.67□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.67□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
NEW1Q08972 UTP10YJL109C 5310 nt0.65□□□□□ -2.31
NEW1Q08972 IQG1YPL242C 4488 nt0.64□□□□□ -2.31
NEW1Q08972 SKI7YOR076C 2244 nt0.61□□□□□ -2.31
NEW1Q08972 THO2YNL139C 4794 nt0.61□□□□□ -2.31
NEW1Q08972 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.61□□□□□ -2.31
NEW1Q08972 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.6□□□□□ -2.31
NEW1Q08972 snR67snR67 82 nt0.54□□□□□ -2.32
NEW1Q08972 FMP27YLR454W 7887 nt0.51□□□□□ -2.33
NEW1Q08972 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.5□□□□□ -2.33
NEW1Q08972 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.43□□□□□ -2.34
NEW1Q08972 SOV1YMR066W 2697 nt0.41□□□□□ -2.34
NEW1Q08972 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.4□□□□□ -2.35
NEW1Q08972 snR75snR75 89 nt0.39□□□□□ -2.35
NEW1Q08972 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.39□□□□□ -2.35
NEW1Q08972 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.39□□□□□ -2.35
NEW1Q08972 ESP1YGR098C 4893 nt0.36□□□□□ -2.35
NEW1Q08972 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.35□□□□□ -2.35
NEW1Q08972 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.35□□□□□ -2.35
NEW1Q08972 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.33□□□□□ -2.36
NEW1Q08972 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.3□□□□□ -2.36
NEW1Q08972 snR128snR128 126 nt0.21□□□□□ -2.38
NEW1Q08972 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.2□□□□□ -2.38
NEW1Q08972 snR77snR77 88 nt0.18□□□□□ -2.38
NEW1Q08972 PAU9YBL108C-A 129 nt0.18□□□□□ -2.38
NEW1Q08972 SBH2YER019C-A 267 nt0.12□□□□□ -2.39
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