Protein–RNA interactions for Protein: Q08622

GEP3, Genetic interactor of prohibitins 3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEP3Q08622 PAU12YGR294W 363 nt1.01□□□□□ -2.25
GEP3Q08622 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.01□□□□□ -2.25
GEP3Q08622 PAU24YBR301W 363 nt1.01□□□□□ -2.25
GEP3Q08622 EST1YLR233C 2100 nt0.98□□□□□ -2.25
GEP3Q08622 ULP2YIL031W 3105 nt0.98□□□□□ -2.25
GEP3Q08622 NST1YNL091W 3723 nt0.97□□□□□ -2.25
GEP3Q08622 SPT7YBR081C 3999 nt0.97□□□□□ -2.25
GEP3Q08622 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.97□□□□□ -2.25
GEP3Q08622 snR69snR69 101 nt0.96□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt0.96□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 ORC3YLL004W 1851 nt0.95□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 RDS3YPR094W 324 nt0.94□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 snR64snR64 101 nt0.93□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 snR50snR50 90 nt0.93□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.92□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 RKR1YMR247C 4689 nt0.92□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 VAM6YDL077C 3150 nt0.91□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.91□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 snR53snR53 91 nt0.91□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 NIP1YMR309C 2439 nt0.9□□□□□ -2.26
GEP3Q08622 SIP4YJL089W 2490 nt0.9□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 UTP20YBL004W 7482 nt0.9□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 SCC2YDR180W 4482 nt0.89□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 MYO1YHR023W 5787 nt0.89□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 RPL41AYDL184C 78 nt0.87□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.87□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 YKL225WYKL225W 348 nt0.87□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.87□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 BUL2YML111W 2763 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.86□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 BEM2YER155C 6504 nt0.85□□□□□ -2.27
GEP3Q08622 YPR117WYPR117W 7470 nt0.83□□□□□ -2.28
GEP3Q08622 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.82□□□□□ -2.28
GEP3Q08622 LTE1YAL024C 4308 nt0.82□□□□□ -2.28
GEP3Q08622 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.81□□□□□ -2.28
GEP3Q08622 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.8□□□□□ -2.28
GEP3Q08622 AI1Q0050 2505 nt0.79□□□□□ -2.28
GEP3Q08622 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.76□□□□□ -2.29
GEP3Q08622 SKI7YOR076C 2244 nt0.75□□□□□ -2.29
GEP3Q08622 PET111YMR257C 2403 nt0.73□□□□□ -2.29
GEP3Q08622 YOL014WYOL014W 375 nt0.73□□□□□ -2.29
GEP3Q08622 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.73□□□□□ -2.29
GEP3Q08622 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.71□□□□□ -2.3
GEP3Q08622 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.71□□□□□ -2.3
GEP3Q08622 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.7□□□□□ -2.3
GEP3Q08622 snR38snR38 95 nt0.7□□□□□ -2.3
GEP3Q08622 YMR160WYMR160W 2451 nt0.69□□□□□ -2.3
GEP3Q08622 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.66□□□□□ -2.3
GEP3Q08622 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.64□□□□□ -2.31
GEP3Q08622 snR67snR67 82 nt0.64□□□□□ -2.31
GEP3Q08622 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.64□□□□□ -2.31
GEP3Q08622 THO2YNL139C 4794 nt0.62□□□□□ -2.31
GEP3Q08622 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.61□□□□□ -2.31
GEP3Q08622 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.58□□□□□ -2.32
GEP3Q08622 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt0.57□□□□□ -2.32
GEP3Q08622 UTP10YJL109C 5310 nt0.55□□□□□ -2.32
GEP3Q08622 FMP27YLR454W 7887 nt0.54□□□□□ -2.32
GEP3Q08622 MLP1YKR095W 5628 nt0.54□□□□□ -2.32
GEP3Q08622 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.53□□□□□ -2.32
GEP3Q08622 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 snR75snR75 89 nt0.5□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.5□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.49□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 MLP2YIL149C 5040 nt0.49□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.47□□□□□ -2.33
GEP3Q08622 IQG1YPL242C 4488 nt0.44□□□□□ -2.34
GEP3Q08622 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.39□□□□□ -2.35
GEP3Q08622 ESP1YGR098C 4893 nt0.37□□□□□ -2.35
GEP3Q08622 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.36□□□□□ -2.35
GEP3Q08622 PAU9YBL108C-A 129 nt0.35□□□□□ -2.35
GEP3Q08622 snR128snR128 126 nt0.34□□□□□ -2.36
GEP3Q08622 SOV1YMR066W 2697 nt0.3□□□□□ -2.36
GEP3Q08622 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.27□□□□□ -2.37
GEP3Q08622 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.24□□□□□ -2.37
GEP3Q08622 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.24□□□□□ -2.37
GEP3Q08622 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.21□□□□□ -2.38
GEP3Q08622 SBH2YER019C-A 267 nt0.19□□□□□ -2.38
GEP3Q08622 snR77snR77 88 nt0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.9 ms