Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFF3Q07654 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFF3Q07654 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms