Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KDSRQ06136 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KDSRQ06136 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms