Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIN1Q05586 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIN1Q05586 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms