Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 EST1YLR233C 2100 nt1.05□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.05□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt1.05□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt1.05□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 snR62snR62 100 nt1.04□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 snR69snR69 101 nt1.04□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 NIP1YMR309C 2439 nt1.04□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 YJR029WYJR029W 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 RPS26AYGL189C 360 nt1.03□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 LTE1YAL024C 4308 nt1.03□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 RKR1YMR247C 4689 nt1.03□□□□□ -2.24
HRQ1Q05549 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.02□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 snR45snR45 172 nt1.02□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 EMT1tM(CAU)D 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 EMT4tM(CAU)M 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 RDS3YPR094W 324 nt0.99□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 BUL2YML111W 2763 nt0.98□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt0.98□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.97□□□□□ -2.25
HRQ1Q05549 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.96□□□□□ -2.26
HRQ1Q05549 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.96□□□□□ -2.26
HRQ1Q05549 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.96□□□□□ -2.26
HRQ1Q05549 PET111YMR257C 2403 nt0.94□□□□□ -2.26
HRQ1Q05549 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt0.93□□□□□ -2.26
HRQ1Q05549 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt0.89□□□□□ -2.27
HRQ1Q05549 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.89□□□□□ -2.27
HRQ1Q05549 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.89□□□□□ -2.27
HRQ1Q05549 MLP1YKR095W 5628 nt0.87□□□□□ -2.27
HRQ1Q05549 YMR160WYMR160W 2451 nt0.85□□□□□ -2.27
HRQ1Q05549 snR47snR47 99 nt0.85□□□□□ -2.27
HRQ1Q05549 YOL014WYOL014W 375 nt0.83□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.81□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 ORC3YLL004W 1851 nt0.78□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt0.78□□□□□ -2.28
HRQ1Q05549 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.73□□□□□ -2.29
HRQ1Q05549 YML054C-AYML054C-A 159 nt0.73□□□□□ -2.29
HRQ1Q05549 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.73□□□□□ -2.29
HRQ1Q05549 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.72□□□□□ -2.29
HRQ1Q05549 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.72□□□□□ -2.29
HRQ1Q05549 IQG1YPL242C 4488 nt0.7□□□□□ -2.3
HRQ1Q05549 AI1Q0050 2505 nt0.69□□□□□ -2.3
HRQ1Q05549 snR50snR50 90 nt0.68□□□□□ -2.3
HRQ1Q05549 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.67□□□□□ -2.3
HRQ1Q05549 RPL41AYDL184C 78 nt0.66□□□□□ -2.3
HRQ1Q05549 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.66□□□□□ -2.3
HRQ1Q05549 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.65□□□□□ -2.31
HRQ1Q05549 THO2YNL139C 4794 nt0.62□□□□□ -2.31
HRQ1Q05549 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt0.62□□□□□ -2.31
HRQ1Q05549 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt0.62□□□□□ -2.31
HRQ1Q05549 MLP2YIL149C 5040 nt0.6□□□□□ -2.31
HRQ1Q05549 UTP10YJL109C 5310 nt0.59□□□□□ -2.32
HRQ1Q05549 YKL225WYKL225W 348 nt0.58□□□□□ -2.32
HRQ1Q05549 snR64snR64 101 nt0.57□□□□□ -2.32
HRQ1Q05549 snR67snR67 82 nt0.57□□□□□ -2.32
HRQ1Q05549 FMP27YLR454W 7887 nt0.56□□□□□ -2.32
HRQ1Q05549 MYO1YHR023W 5787 nt0.51□□□□□ -2.33
HRQ1Q05549 snR53snR53 91 nt0.49□□□□□ -2.33
HRQ1Q05549 snR38snR38 95 nt0.47□□□□□ -2.33
HRQ1Q05549 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.41□□□□□ -2.34
HRQ1Q05549 SOV1YMR066W 2697 nt0.36□□□□□ -2.35
HRQ1Q05549 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.36□□□□□ -2.35
HRQ1Q05549 SKI7YOR076C 2244 nt0.36□□□□□ -2.35
HRQ1Q05549 ESP1YGR098C 4893 nt0.35□□□□□ -2.35
HRQ1Q05549 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.34□□□□□ -2.36
HRQ1Q05549 snR128snR128 126 nt0.32□□□□□ -2.36
HRQ1Q05549 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt0.22□□□□□ -2.37
HRQ1Q05549 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.2□□□□□ -2.38
HRQ1Q05549 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt0.19□□□□□ -2.38
HRQ1Q05549 PAU9YBL108C-A 129 nt0.17□□□□□ -2.38
HRQ1Q05549 YJL113WYJL113W 4647 nt0.14□□□□□ -2.39
HRQ1Q05549 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt0.05□□□□□ -2.4
HRQ1Q05549 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.01□□□□□ -2.41
HRQ1Q05549 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.03□□□□□ -2.41
HRQ1Q05549 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-0.06□□□□□ -2.42
HRQ1Q05549 SBH2YER019C-A 267 nt-0.06□□□□□ -2.42
HRQ1Q05549 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.06□□□□□ -2.42
HRQ1Q05549 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.09□□□□□ -2.42
HRQ1Q05549 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-0.18□□□□□ -2.44
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